在航空航天工程中，甲级监理公司在进行土方回填质量检查时，通常会采取以下措施：

1. 土方样品采集：从不同的回填区域和深度采集土方样品，保证样品的代表性。

2. 土方质量检测：对土方样品进行实验室测试，包括土壤类型、含水量、密实度等指标的检测，用于评估土方的质量。

3. 回填层次检查：检查土方回填的层次和厚度是否符合设计要求，确保每层回填土的高度和均匀性。

4. 压实度检测：通过测量土方回填后的压实度来评估土方的密实程度，可以使用压实试验或非破坏性检测设备进行检测。

5. 沉降监测：对土方回填后的沉降进行监测，观察并记录沉降情况，以判断土方回填是否均匀且沉降稳定。

6. 现场检查和记录：定期到施工现场进行实地检查，检查土方回填的质量和施工过程是否符合相关标准和规范，并将检查结果记录下来。

通过以上检查措施，甲级监理公司可以全面评估土方回填的质量状况，确保土方回填质量符合设计要求和标准，避免因质量问题引发的工程安全隐患和不可预见的后续问题。